
Pisa è situata nel centro nord della Penisola, a circa 80 km da Firenze, 170 km da Genova e 330 km da Roma.

Le modalità di accesso alla città sono molte:
Se arrivate in automobile dall'Autostrada A12 (Genova - Rosignano), l'uscita è quella di Pisa Nord che immette direttamente sulla Strada Statale n.1 Aurelia. Appena fuori dall'autostrada girate a sinistra in direzione Pisa. Arrivati in prossimità di Madonna dell'Acqua seguite la strada che percorre una curva verso destra. Arrivati al successivo semaforo girate a sinistra per Via delle Cascine e continuate dritto per Via Contessa Matilde e Via del Brennero. Seguire le indicazioni per la Scuola Sant'Anna, passando sotto la vecchia porta della mura cittadine e raggiungete Piazza San Zeno dove troverete un'area di parcheggio a pagamento (1,5€/h). Se il parcheggio è pieno o se preferite un'area di parcheggio gratuita, proseguite per via del Brennero dove, dopo la rotonda, troverete sulla vostra sinistra una grande area di parcheggio ben collegata al centro storico da frequenti navette. Alternativamente potete andare a piedi: Pisa è una piccola cità. Se siete diretti verso un hotel nel centro storico potete entrare nella ZTL (Zona a Traffico minitato) a patto di comunicare poi il vostro numero di targa una volta arrivati alla reception;
La stazione ferroviaria di Pisa Centrale è collegata con le maggiori cità italiane ed europee attraverso i nodi di Firenze, Torino/Genova e Roma. Il modo più facile per raggiungere la Scuola dalla stazione è quello di fare una passeggata nel centro di Pisa: la Scuola Superiore Sant'Anna dista infatti solo 20 minuti dalla stazione ferroviaria. Una volta fuori dalla stazione proseguite diritto per Piazza Vittorio Emanuele e successivamente per Corso Italia, superate quindi il Ponte di Mezzo e proseguite per Borgo Stretto fino alla fine dove girerete alla vostra destra per Via San Lorenzo. Qualora desideriate usare i mezzi pubblici potrete prendere l'autobus numero 2 (direzione Porta a Lucca) o il numero 4 (direzione I Passi) in entrambi i casi la fermata è quella di Piazza San Zeno. Alternativamente è sempre possibile prendere un taxi (il prezzo della corsa è circa 5€)
L'aeroporto internazionale Galileo Galilei è collegato quotidianamente con Milano, Roma, Londra, Parigi e molte altre città italiane ed europee. Oltre alle compagnie di bandiera, l'aeroporto di Pisa è scalo di numerose compagnie aeree low-cost. Per arrivare alla Scuola si consiglia di prendere un taxi (il prezzo della corsa è circa 8€). Alternativamente potete prendere l'autobus numero 3, scendendo alla fermata Ponte di Mezzo, traversate a piedi il ponte e proseguite diritto per Borgo Stretto fino all'incrocio con via San Lorenzo dove a pochi metri alla vostra destra si trova l'ingresso della Scuola.